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美吉生物助力客戶登陸Cell子刊--RNA-Seq揭示LSD2的雙酶活性

項目文章2016-10-20 17:52

你造嗎?美吉生物又創佳績啦!哦?又有神馬好消息了!美吉與上海復旦醫學院徐彥輝研究小組合作,研究成果發表于《Molecular cell》雜志上。哇塞,這么高大上??!它可是大名鼎鼎的cell子刊,影響因子高達14.018呢??燉唇步艙餛笞靼?。別急,就讓小編為您細細道來。

2015年4月來自復旦大學醫學院的徐彥輝研究組在著名國際期刊Molecular Cell發表了最新研究進展,該研究發現組蛋白去甲基化酶LSD2同時具有E3泛素連接酶活性,LSD2能夠依賴其泛素連接酶活性促進O-GlcNAc糖基轉移酶降解,從而發揮抗腫瘤功能。

本研究測序相關工作由美吉生物承擔:采用HiSeq 2500測序平臺,通過轉錄組分析在整體水平上研究基因功能,并揭示了特定生物學過程及疾病發生過程的分子機制。

采用mRNA-Seq方法,揭示了LSD2能夠通過其去甲基化酶活性和E3泛素連接酶功能調控不同靶基因表達(圖1A)。

圖1 depletionoverexpression LSD2導致293TA459細胞系轉錄組表達譜發生明顯變化


為了理解該基因在細胞中的功能所在,文章進一步對差異表達基因進行GO注釋,結果顯示在293T細胞中LSD2參與了包括細胞發育,程序性死亡,細胞凋亡,信號傳遞,蛋白激酶活性等細胞過程 (圖2C),而在A459細胞中,LSD2則可以參與類固醇代謝,細胞生長與增值及細胞粘附,免疫反應等過程(圖2G,圖2H)。這些證據為文中的主題提供了可靠的數據支持。

圖2 由LSD2調控的293TA459細胞差異表達基因的GO功能注釋分析


美吉公司衷心祝賀這一高水平文章的發表,十分榮幸能為該文章的轉錄組研究提供服務,同時非常感謝徐老師研究組對美吉的信任和認可。祝愿美吉的客戶能夠取得豐碩的成果。
文獻原文:
Yi Yang, Xiaotong Yin, Huirong Yang,Yanhui Xu. Histone Demethylase LSD2 Acts as an E3 Ubiquitin Ligase and Inhibits Cancer Cell Growth through Promoting Proteasomal Degradation of OGT [J]. Molecular Cell. 2015,
4: //dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2015.01.038
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